Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lrit1Q8K099 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit1Q8K099 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms