Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp20Q8C6M1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Usp20Q8C6M1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Usp20Q8C6M1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Usp20Q8C6M1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp20Q8C6M1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp20Q8C6M1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp20Q8C6M1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Usp20Q8C6M1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp20Q8C6M1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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