Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pggt1bQ8BUY9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms