Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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