Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rnf139Q7TMV1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rnf139Q7TMV1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rnf139Q7TMV1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rnf139Q7TMV1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rnf139Q7TMV1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rnf139Q7TMV1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rnf139Q7TMV1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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