Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarca2Q6DIC0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms