Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CltcQ68FD5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms