Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Ccdc18Q640L5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Ccdc18Q640L5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Ccdc18Q640L5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Ccdc18Q640L5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Ccdc18Q640L5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Ccdc18Q640L5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Ccdc18Q640L5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Ccdc18Q640L5 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Ccdc18Q640L5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Ccdc18Q640L5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Ccdc18Q640L5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc18Q640L5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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