Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctr9Q62018 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms