Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tbc1d1Q60949 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tbc1d1Q60949 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tbc1d1Q60949 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tbc1d1Q60949 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tbc1d1Q60949 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tbc1d1Q60949 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tbc1d1Q60949 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tbc1d1Q60949 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tbc1d1Q60949 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tbc1d1Q60949 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tbc1d1Q60949 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tbc1d1Q60949 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tbc1d1Q60949 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tbc1d1Q60949 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tbc1d1Q60949 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tbc1d1Q60949 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tbc1d1Q60949 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tbc1d1Q60949 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tbc1d1Q60949 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tbc1d1Q60949 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tbc1d1Q60949 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tbc1d1Q60949 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tbc1d1Q60949 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms