Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Utp20Q5XG71 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp20Q5XG71 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp20Q5XG71 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp20Q5XG71 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp20Q5XG71 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp20Q5XG71 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp20Q5XG71 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp20Q5XG71 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp20Q5XG71 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp20Q5XG71 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp20Q5XG71 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp20Q5XG71 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp20Q5XG71 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp20Q5XG71 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp20Q5XG71 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp20Q5XG71 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp20Q5XG71 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Utp20Q5XG71 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp20Q5XG71 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp20Q5XG71 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp20Q5XG71 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp20Q5XG71 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp20Q5XG71 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Utp20Q5XG71 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms