Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms