Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neurl1bQ0MW30 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neurl1bQ0MW30 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neurl1bQ0MW30 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neurl1bQ0MW30 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neurl1bQ0MW30 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Neurl1bQ0MW30 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neurl1bQ0MW30 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neurl1bQ0MW30 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neurl1bQ0MW30 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Neurl1bQ0MW30 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neurl1bQ0MW30 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neurl1bQ0MW30 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neurl1bQ0MW30 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms