Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cux2P70298 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cux2P70298 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cux2P70298 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cux2P70298 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cux2P70298 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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