Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia3P60469 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms