Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csrnp1P59054 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms