Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Mmp20P57748 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Mmp20P57748 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Mmp20P57748 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Mmp20P57748 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Mmp20P57748 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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