Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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