Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms