Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LtbP41155 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LtbP41155 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LtbP41155 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LtbP41155 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LtbP41155 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LtbP41155 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LtbP41155 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LtbP41155 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LtbP41155 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LtbP41155 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LtbP41155 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LtbP41155 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LtbP41155 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LtbP41155 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LtbP41155 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms