Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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