Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NapbP28663 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NapbP28663 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NapbP28663 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NapbP28663 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NapbP28663 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms