Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RarbP22605 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RarbP22605 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RarbP22605 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms