Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc1P19123 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms