Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb4P10284 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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