Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BlmO88700 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BlmO88700 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BlmO88700 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BlmO88700 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BlmO88700 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BlmO88700 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BlmO88700 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BlmO88700 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BlmO88700 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BlmO88700 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BlmO88700 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BlmO88700 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BlmO88700 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BlmO88700 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BlmO88700 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BlmO88700 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BlmO88700 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BlmO88700 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BlmO88700 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BlmO88700 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BlmO88700 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BlmO88700 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BlmO88700 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BlmO88700 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BlmO88700 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BlmO88700 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BlmO88700 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BlmO88700 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BlmO88700 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BlmO88700 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BlmO88700 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BlmO88700 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BlmO88700 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BlmO88700 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BlmO88700 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BlmO88700 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BlmO88700 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BlmO88700 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BlmO88700 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BlmO88700 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BlmO88700 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BlmO88700 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BlmO88700 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BlmO88700 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BlmO88700 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BlmO88700 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BlmO88700 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BlmO88700 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BlmO88700 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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