Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms