Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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