Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3443F7CCV5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms