Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc170D3YXL0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms