Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfx8D3YU81 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rfx8D3YU81 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rfx8D3YU81 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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