Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm6880A3KG45 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Gm6880A3KG45 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gm6880A3KG45 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gm6880A3KG45 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Gm6880A3KG45 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Gm6880A3KG45 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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