Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Homer1Q9Z2Y3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Homer1Q9Z2Y3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Homer1Q9Z2Y3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms