Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z255

Ube2a, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2aQ9Z255 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2aQ9Z255 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2aQ9Z255 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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