Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sumo3Q9Z172 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sumo3Q9Z172 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms