Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp1a4Q9WV27 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp1a4Q9WV27 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp1a4Q9WV27 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1a4Q9WV27 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms