Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sorbs3Q9R1Z8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sorbs3Q9R1Z8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sorbs3Q9R1Z8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms