Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfwd2Q9R1A8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms