Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr4a3Q9QZB6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr4a3Q9QZB6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr4a3Q9QZB6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr4a3Q9QZB6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr4a3Q9QZB6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr4a3Q9QZB6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr4a3Q9QZB6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr4a3Q9QZB6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr4a3Q9QZB6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr4a3Q9QZB6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.4 ms