Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdzd4Q9QY39 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdzd4Q9QY39 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms