Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Opn4Q9QXZ9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Opn4Q9QXZ9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Opn4Q9QXZ9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Opn4Q9QXZ9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Opn4Q9QXZ9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Opn4Q9QXZ9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Opn4Q9QXZ9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Opn4Q9QXZ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Opn4Q9QXZ9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Opn4Q9QXZ9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Opn4Q9QXZ9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Opn4Q9QXZ9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Opn4Q9QXZ9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn4Q9QXZ9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms