Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trip4Q9QXN3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trip4Q9QXN3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trip4Q9QXN3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip4Q9QXN3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip4Q9QXN3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms