Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpsf3Q9QXK7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpsf3Q9QXK7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpsf3Q9QXK7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpsf3Q9QXK7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpsf3Q9QXK7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpsf3Q9QXK7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpsf3Q9QXK7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpsf3Q9QXK7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpsf3Q9QXK7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpsf3Q9QXK7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpsf3Q9QXK7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpsf3Q9QXK7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpsf3Q9QXK7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpsf3Q9QXK7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpsf3Q9QXK7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpsf3Q9QXK7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpsf3Q9QXK7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpsf3Q9QXK7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpsf3Q9QXK7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms