Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trp53inp1Q9QXE4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trp53inp1Q9QXE4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms