Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tcea2Q9QVN7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms