Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUP5

Hapln1, Hyaluronan and proteoglycan link protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln1Q9QUP5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hapln1Q9QUP5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hapln1Q9QUP5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hapln1Q9QUP5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms