Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nectin3Q9JLB9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nectin3Q9JLB9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms