Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uchl3Q9JKB1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uchl3Q9JKB1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uchl3Q9JKB1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uchl3Q9JKB1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uchl3Q9JKB1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uchl3Q9JKB1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uchl3Q9JKB1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl3Q9JKB1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl3Q9JKB1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl3Q9JKB1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl3Q9JKB1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl3Q9JKB1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl3Q9JKB1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl3Q9JKB1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl3Q9JKB1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl3Q9JKB1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl3Q9JKB1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uchl3Q9JKB1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uchl3Q9JKB1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uchl3Q9JKB1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms