Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmbr1Q9JIT0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms