Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc5a4aQ9ET37 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc5a4aQ9ET37 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc5a4aQ9ET37 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms